Там же написано всё:
ГСБ прекрасно понимает что это шифр который могут использовать шпионы других корпораций
Он не знает, что это книга именно Синдиката. Он не знает, что это книга именно о языке синдиката. Он просто знает, что в этой книги описаны инструкции к шифру и тот, кто её носит, вероятнее всего принадлежит к какой-либо террористической группировке